40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4566 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  36.52 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  37.98 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  35.62 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  34.52 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  34.6 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  34.64 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  35.96 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  34.6 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  35.67 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  34.52 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  35.67 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  36.21 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  31.25 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  34.8 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  35.04 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  32.88 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  34.27 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.16 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  31.62 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  28.22 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  25.78 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  28.17 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  27.96 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  26.9 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  26.6 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  37.89 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  23.74 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0855  hypothetical protein  29.03 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  23.97 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  42.19 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  43.55 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  33.73 
 
 		 187 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  30.51 
 
 		 567 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  40.62 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  40.62 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>