26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0850 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0850  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.764335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0862  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  98.38 
 
 		 189 aa  369  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0827  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  95.14 
 
 		 189 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0707  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  74.56 
 
 		 180 aa  267  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3427  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  74.56 
 
 		 180 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3315  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  73.37 
 
 		 180 aa  262  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0851  hypothetical protein  71.43 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3252  Type IV pili fiber-building block protein  25.84 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.76 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  31.82 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  42.19 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  34.91 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.47 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  25.71 
 
 		 329 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.77 
 
 		 340 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0487  methylation  27.01 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.856332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  33.87 
 
 		 344 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.41 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  30 
 
 		 328 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.41 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  31.08 
 
 		 385 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  37.7 
 
 		 395 aa  41.2  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  35.48 
 
 		 341 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  36.07 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>