19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0851 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0851  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0707  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  85.96 
 
 		 180 aa  313  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3427  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  85.39 
 
 		 180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3315  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  85.39 
 
 		 180 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0862  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  70.93 
 
 		 189 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0827  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  72.09 
 
 		 189 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0850  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  71.43 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.764335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3252  Type IV pili fiber-building block protein  32.97 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0487  methylation  26.21 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.856332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  26.32 
 
 		 388 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  29.85 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  28.77 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  36.76 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.47 
 
 		 337 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  26.88 
 
 		 329 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 385 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  23.08 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  32.35 
 
 		 343 aa  41.2  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>