30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0986 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  423  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  99.5 
 
 		 202 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  99.5 
 
 		 202 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  50.83 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  49.73 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3819  putative prepilin peptidase dependent protein  46.24 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21629  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  45.95 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3193  hypothetical protein  44.92 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3267  hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3325  hypothetical protein  35.11 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0234254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3211  hypothetical protein  34.57 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0227647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3145  hypothetical protein  35.11 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3162  hypothetical protein  34.64 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.371591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3225  hypothetical protein  34.64 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0159896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4090  hypothetical protein  30.89 
 
 		 187 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171812  normal  0.628463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3145  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0305853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02673  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.315688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02634  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2972  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157774  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3037  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0890  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2971  hypothetical protein  30.37 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0866  prepilin peptidase dependent protein B  30.37 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  25.63 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  28.57 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  22.82 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.58 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0265  hypothetical protein  20.74 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  28.32 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  36.21 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>