17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2931 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  41.92 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  28.32 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.18 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  33.85 
 
 		 290 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  25.6 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  26.95 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 385 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  34.52 
 
 		 341 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  40.91 
 
 		 344 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  29.49 
 
 		 357 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  27.17 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  25.45 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  28.32 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  28.32 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  28.32 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.71 
 
 		 226 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>