34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3394 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  88.67 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  48.94 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  51.38 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  51.38 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  50.83 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3193  hypothetical protein  50.52 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3819  putative prepilin peptidase dependent protein  46.39 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21629  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3267  hypothetical protein  38.55 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3145  hypothetical protein  31.98 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3325  hypothetical protein  31.98 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0234254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3211  hypothetical protein  31.4 
 
 		 187 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0227647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4090  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171812  normal  0.628463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3145  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0305853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2972  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157774  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3037  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2971  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0890  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0866  prepilin peptidase dependent protein B  30.26 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02634  hypothetical protein  29.61 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02673  hypothetical protein  29.61 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.315688  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3162  hypothetical protein  30.49 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.371591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3225  hypothetical protein  30.49 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0159896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  26.24 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  28.22 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  27.17 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  32.94 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  25.49 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.1 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.57 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1977  hypothetical protein  32.61 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1972  hypothetical protein  38.24 
 
 		 268 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  32.26 
 
 		 290 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004286  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  24.39 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>