26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0680 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0680  putative type IV pilus assembly protein PilW  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.23 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  27.84 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  25 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  24.58 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  27.12 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3819  putative prepilin peptidase dependent protein  24.14 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21629  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0669  hypothetical protein  24.64 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0590656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004286  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  23.88 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0386  hypothetical protein  25.25 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.58 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3193  hypothetical protein  26.37 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.53 
 
 		 337 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01138  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  25.49 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  24.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.58 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.51 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  24.38 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3429  hypothetical protein  21.03 
 
 		 307 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.47 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  24.1 
 
 		 202 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  23.93 
 
 		 202 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  23.93 
 
 		 202 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.6 
 
 		 328 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  28.92 
 
 		 344 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>