62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0868 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  100 
 
 		 429 aa  875    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  32.33 
 
 		 341 aa  146  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  26.21 
 
 		 346 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  27.55 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  27.04 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  27.98 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  28.12 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.91 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  25.64 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  25.64 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  27.32 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  27.11 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  24.47 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  22.75 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.49 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  24.87 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  38.67 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  25.13 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  23.34 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  38.03 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  23.05 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.1 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  36.23 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  34.04 
 
 		 329 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  37.88 
 
 		 242 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  36.67 
 
 		 226 aa  53.5  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  42.42 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.46 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  35.29 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  35.29 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.18 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  35.21 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.33 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  35.38 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.25 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  31.94 
 
 		 217 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  35.38 
 
 		 322 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.92 
 
 		 250 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  38.46 
 
 		 324 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.35 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  31.3 
 
 		 273 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  38.24 
 
 		 275 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  28.43 
 
 		 215 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.82 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  34.29 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  34.38 
 
 		 237 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  30.12 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  30.77 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0213  hypothetical protein  33.78 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  31.34 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3252  Type IV pili fiber-building block protein  33.33 
 
 		 193 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  34.85 
 
 		 214 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  21.9 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  33.71 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  25.37 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  23.88 
 
 		 227 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.34 
 
 		 290 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  30.3 
 
 		 357 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>