33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0965 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3436  hypothetical protein  25.21 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  28.57 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1698  hypothetical protein  25.45 
 
 		 299 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  28.16 
 
 		 385 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1807  hypothetical protein  35.29 
 
 		 415 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  37.7 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.73 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  31.43 
 
 		 388 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  32.26 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  22.08 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  33.87 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  33.85 
 
 		 377 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  33.85 
 
 		 377 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  34.85 
 
 		 382 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.23 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  36.51 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  31.25 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  23.88 
 
 		 429 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.5 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  32.53 
 
 		 343 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3429  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  31.67 
 
 		 418 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0727  hypothetical protein  33.85 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.912557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  31.67 
 
 		 418 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.84 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  32.79 
 
 		 323 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  30.77 
 
 		 332 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  35.48 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  35.48 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  29.41 
 
 		 322 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1064  hypothetical protein  31.91 
 
 		 308 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>