21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3827 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  790    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  63.28 
 
 		 353 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  27.78 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  35.37 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.39 
 
 		 269 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  27.08 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  33.77 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 349 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  20.9 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.81 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  27.95 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.5 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  34.33 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  28.57 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  28.08 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  34.85 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  27.78 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  28.79 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.76 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1824  hypothetical protein  27.13 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  26.98 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>