73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0785 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  100 
 
 		 273 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  27.81 
 
 		 334 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.96 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  30.88 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  28.63 
 
 		 328 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  29.82 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  31.01 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  31.87 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.43 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.8 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.46 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.29 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  27.74 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  21.78 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  25.45 
 
 		 341 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  28.81 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  24.65 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  26.28 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  31.16 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  31.16 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  31.16 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  31.16 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  31.16 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  30.77 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  28.79 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  26.07 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.68 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  37.66 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  34.74 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  22.77 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  30.14 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  22.77 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.78 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.77 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  25.87 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  22.46 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  22.15 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  44.26 
 
 		 385 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  33.08 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  39 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  25.95 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  39 
 
 		 344 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  24.5 
 
 		 347 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  26.52 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  31.16 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  36.76 
 
 		 388 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  25.09 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.26 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  25.65 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.25 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  31.3 
 
 		 429 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  36.78 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  33.8 
 
 		 346 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.34 
 
 		 212 aa  48.9  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  26.98 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  25 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  27.13 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  36.11 
 
 		 418 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  39.39 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  36.11 
 
 		 418 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.98 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  21.4 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  22.5 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  27.13 
 
 		 382 aa  45.4  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2883  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.67 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2022  hypothetical protein  24.85 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0629  hypothetical protein  40.91 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0663  hypothetical protein  39.39 
 
 		 423 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  21.91 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  22.43 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3186  hypothetical protein  21.4 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  29.58 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0674  hypothetical protein  34.29 
 
 		 420 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>