17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2883 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2883  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0960  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.5 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.775575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  31.75 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  30.99 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  28.04 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  28.16 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  33.7 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  39.73 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  24.38 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.88 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.49 
 
 		 333 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  30.88 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  28.14 
 
 		 349 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  35.29 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.88 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  37.84 
 
 		 322 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  37.84 
 
 		 322 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>