40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5192 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  100 
 
 		 274 aa  563  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  53.11 
 
 		 275 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0960  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  40.68 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.775575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2883  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.99 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  49.21 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  49.21 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  43.94 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  33.33 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  36.92 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  40 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  37.1 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  36.23 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.34 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  24.54 
 
 		 328 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  25.76 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  33.33 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0663  hypothetical protein  24.87 
 
 		 423 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  25.71 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  38.46 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  31.43 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  35.94 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  33.33 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  31.43 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  31.43 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  34.85 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  31.43 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.51 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.43 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.29 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  24.82 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.38 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  33.33 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0629  hypothetical protein  23.86 
 
 		 423 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0674  hypothetical protein  29.51 
 
 		 420 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  33.87 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  21.28 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  32.31 
 
 		 382 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  20.63 
 
 		 349 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.16 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.92 
 
 		 333 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>