27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0524 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  22.36 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.5 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  31.58 
 
 		 344 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  31.94 
 
 		 429 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  21.5 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  21.52 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  36.36 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  31.17 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  22.92 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  33.33 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  30.14 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  32.31 
 
 		 418 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  32.31 
 
 		 418 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  20 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  23.21 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  33.82 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  35.59 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  27.94 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  26.03 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1977  hypothetical protein  32.69 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  32.05 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1972  hypothetical protein  31.73 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  33.87 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  25.95 
 
 		 373 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  20.7 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  26.24 
 
 		 316 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>