49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0769 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  85.87 
 
 		 269 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  63.43 
 
 		 280 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  55.64 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  56.11 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  56.11 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  56.11 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  56.11 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  56.11 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  56.11 
 
 		 434 aa  251  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  55.73 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  52.14 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  50.97 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  49.43 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  49.03 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  27.24 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  30.55 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25.8 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  29.71 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.03 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  29.37 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  27.04 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  27.24 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  29.01 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  25.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25.99 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  28.92 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  25.84 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  24.87 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.17 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  26.19 
 
 		 341 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  33.71 
 
 		 429 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.33 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  21.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  24.21 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  29.9 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.05 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  34.78 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  34.72 
 
 		 388 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  22.97 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5189  hypothetical protein  27.59 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  24.4 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.73 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  25.37 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01138  hypothetical protein  37.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0674  hypothetical protein  37.8 
 
 		 420 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  23.17 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>