24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5195 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  634    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3186  hypothetical protein  50.5 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  50.16 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5189  hypothetical protein  45.42 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.18 
 
 		 275 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.35 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  27.74 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  25.84 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  28.79 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  28.03 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  26.26 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  25.37 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.05 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  24.55 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.91 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  23.29 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.21 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  24.27 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  26.52 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  27.24 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  25.85 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  34.43 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  25.32 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>