24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3186 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  604  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  68.52 
 
 		 303 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  50.5 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5189  hypothetical protein  42.75 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.64 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.74 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  35.9 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  22.38 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  38.03 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  24.07 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  35.21 
 
 		 344 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.27 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  40.32 
 
 		 398 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  23.33 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  34.41 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.15 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  28.72 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  30.65 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  33.85 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  26.72 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  33.33 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  28.68 
 
 		 377 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  28.68 
 
 		 377 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>