16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0712 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  92.26 
 
 		 310 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  55.3 
 
 		 313 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  37.14 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  32.59 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  29.91 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  25.77 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  29.37 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  25.65 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  27.1 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.27 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.06 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  27.6 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  27.27 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.64 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>