17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0668 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  92.26 
 
 		 310 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  55.96 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  37.14 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  33.23 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  31.45 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  27.53 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  28.92 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  32.3 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  28.29 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.34 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.95 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  26.18 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  27.64 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  28.83 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  28.95 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  22.82 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>