27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2537 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3186  hypothetical protein  68.85 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  50.16 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5189  hypothetical protein  40.57 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.7 
 
 		 275 aa  99.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.24 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  25.67 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  28.33 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  27.11 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  25.44 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  29.97 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  25.08 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  29.45 
 
 		 434 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.17 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  26.69 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.93 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  40.58 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  36.76 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  37.5 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.26 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  26.64 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  32.31 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  30.65 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>