46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3192 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  98.85 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  99.23 
 
 		 261 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  99.62 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  99.23 
 
 		 261 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  99.23 
 
 		 261 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  99.23 
 
 		 261 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  88.46 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  56.11 
 
 		 270 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  58.56 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  57.09 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  57.48 
 
 		 279 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  54.33 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  55.69 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  55.04 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  30.8 
 
 		 328 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.27 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  31.25 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  30.59 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  32.24 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  29.97 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  31.09 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  26.33 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.8 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.62 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  26.14 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  24.64 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  29.33 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  27.08 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 349 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  30.08 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  35.29 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  36.07 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  36.63 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5189  hypothetical protein  29.41 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  33.87 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  31.43 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  30 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  26.47 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  29.95 
 
 		 349 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  22.94 
 
 		 334 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  34.48 
 
 		 388 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>