31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0684 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  98.87 
 
 		 355 aa  702    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  27.09 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  27.02 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  28.53 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  25.96 
 
 		 418 aa  86.7  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  26.02 
 
 		 418 aa  85.9  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  27.32 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  28.69 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  27.87 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  24.08 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  24.55 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  26.41 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  24.22 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  23.59 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.41 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  30.99 
 
 		 235 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  31.78 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  24.04 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  33.77 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  33.8 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  26.13 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.49 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  23.59 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  26.76 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.99 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  29.9 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  25.27 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  23.8 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  23.8 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  24.73 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>