69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2880 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2880  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  100 
 
 		 391 aa  801    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  45.82 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  43.25 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  29.41 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  30.33 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2913  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  29.9 
 
 		 345 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0402  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  30.38 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  25.76 
 
 		 357 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.69 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  24.35 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  24.3 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.89 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.96 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  25.25 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  24.4 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  25.58 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  23.76 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.5 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.5 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.6 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  26.86 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  20.54 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  27.48 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  19.85 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  19.95 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  19.95 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  27.13 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  27.41 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.71 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  20.96 
 
 		 312 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  24 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  34.85 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  28.17 
 
 		 385 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  30.67 
 
 		 227 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  22.68 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.67 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.37 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  41.54 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  23.02 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  30.99 
 
 		 242 aa  49.7  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1698  hypothetical protein  33.78 
 
 		 299 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  23.5 
 
 		 310 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  33.85 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  32.91 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  26.32 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  38.46 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  35.82 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.25 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  26.03 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  34.25 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0487  methylation  28.15 
 
 		 189 aa  46.6  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.856332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  24.59 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  32.39 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  27.93 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  27.93 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  38.24 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  29.32 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  46.88 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  46.88 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  26.21 
 
 		 215 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  34.38 
 
 		 288 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  28.33 
 
 		 226 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  24.3 
 
 		 250 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  29.68 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.32 
 
 		 178 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.32 
 
 		 178 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>