19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5693 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5693  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 566 aa  1149    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.69156  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  47.22 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  48.61 
 
 		 1145 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  42.47 
 
 		 1544 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  43.06 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  40 
 
 		 1626 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1104 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.59 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  40.74 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.08 
 
 		 648 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  44.83 
 
 		 608 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  42.03 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  31.33 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  29.35 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 193 aa  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  28.87 
 
 		 509 aa  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  48.15 
 
 		 150 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  38.57 
 
 		 137 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  25.61 
 
 		 343 aa  43.5  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>