16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2528 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2215  hypothetical protein  52.35 
 
 		 157 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1602  hypothetical protein  41.96 
 
 		 148 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.17 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  38.18 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  40.58 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1104 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  38.27 
 
 		 631 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  40 
 
 		 603 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  42.11 
 
 		 608 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2777  hypothetical protein  46.94 
 
 		 169 aa  46.6  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  32.74 
 
 		 150 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  38.89 
 
 		 1626 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  38.57 
 
 		 1544 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 648 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1145 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>