16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2215 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  52.17 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1602  hypothetical protein  44.35 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  32.54 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.78 
 
 		 648 aa  50.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.92 
 
 		 680 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2777  hypothetical protein  43.64 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  34.48 
 
 		 631 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  38.46 
 
 		 610 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  35.29 
 
 		 603 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  46.81 
 
 		 1544 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  40.32 
 
 		 608 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  33.75 
 
 		 1626 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1104 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>