27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2740 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1251    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  80.46 
 
 		 608 aa  964    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  47.31 
 
 		 603 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1690  hypothetical protein  34.88 
 
 		 533 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.095239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3822  hypothetical protein  31.43 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3823  hypothetical protein  35.18 
 
 		 529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000781142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  44.14 
 
 		 1626 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  47.75 
 
 		 631 aa  91.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  52 
 
 		 1544 aa  88.2  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.72 
 
 		 680 aa  74.3  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  44.94 
 
 		 1104 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 1128 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  38.71 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1145 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.52 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  35.64 
 
 		 556 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  37.5 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  40.79 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  39.24 
 
 		 257 aa  63.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.67 
 
 		 193 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  40.85 
 
 		 321 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  38.16 
 
 		 275 aa  54.7  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  37.93 
 
 		 150 aa  50.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  42.65 
 
 		 137 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2687  peptidase domain-containing protein  25.98 
 
 		 747 aa  48.5  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2215  hypothetical protein  38.81 
 
 		 157 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5693  Fibronectin type III domain protein  43.06 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.69156  normal  0.441656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>