9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1460 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1460  thermopsin  100 
 
 
586 aa  1154    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  38.85 
 
 
952 aa  176  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1230  thermopsin  35.69 
 
 
320 aa  160  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2683  Thermopsin  38.71 
 
 
556 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  34.58 
 
 
944 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1285  hypothetical protein  28.95 
 
 
671 aa  73.6  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.328698  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0086  hypothetical protein  27.51 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.876374  normal  0.238085 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1231  peptidase A5, thermopsin  26.6 
 
 
924 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0013  Peptidase A5, thermopsin  27.42 
 
 
442 aa  54.7  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>