Gene Cmaq_0086 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagCmaq_0086 
Symbol 
ID5710247 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameCaldivirga maquilingensis IC-167 
KingdomArchaea 
Replicon accessionNC_009954 
Strand
Start bp102776 
End bp104464 
Gene Length1689 bp 
Protein Length562 aa 
Translation table11 
GC content38% 
IMG OID641274589 
Producthypothetical protein 
Protein accessionYP_001539930 
Protein GI159040678 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones21 
Plasmid unclonability p-value0.876374 
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clones31 
Fosmid unclonability p-value0.238085 
Fosmid HitchhikerNo 
Fosmid clonabilitynormal 
 

Sequence

Gene sequence
ATGATAATGC TGGCGCTATT TATTGCAGCA TTAATGCAAC CTCAGTTGGT TAACGTGACC 
CCAGTATCCT TTAATATGAC TATTGGTTCA GGAATGCCCA TGTACGGTTT ATTAATTAAT
CCTAATTCAT CATACGTAAT CTACCTTAAT GGACCGGGGG TGCTCTATAT GGTGGCTAAT
TCATCATTAG TAGTTATGAT TCATAACATG GTTCATGTGG TTAATGGCAG TGCTTCACTA
GTCATTAAGC AGGGTGAGTC GCGTGTATTA TTCATTAATC ATAATAATTA CTCAGTTTAC
TTATTCTACA TGTTTCAATA TAATAGTTCC AGTGAAGCAT TCTACTCCTA TAACCCAATT
GGGGTTGCTG ACTACGGTGT GGCGTTATAT TATGGTGAAC CATTATTGGC TTACTCCTAT
GAAACAAGTG AAGTATTGGG TGTAGCCTTC ATTAGGAGTC TTAATGTAAC TGATGTTAGG
GGTGATTGCG GGGTTAAGGC TGGTGATGAT TATGCTGATA TTCAATTGAA TTCAATAGTA
AAGGCCGGTG ACGGATACTA TATAGTTCAA GATGTTGTTA TACTTAATGG AACTGCAGCA
TCAATTGTTG ATAATGTGTG GAACATAACA TCACTCAACG CCACCTTAAG TAATGTAATG
GGTCTGGGAT CCATAGGCGA CTTCAATGGT CAACAATACT ACGCGTACAG TAGGGTTATA
GGTGAATTAA AAACACCCTT TAACTTAACG TTAGCCATAA TGGTTAGTGG GGTTAATTCA
GCTCACTTAA GCTTCGGTTA TGGTGTTCAA GGGTCATTAA TATGGTTTGA TAACGTTACA
TTGATTAATG CAGGTAAACC AAGCATCATC GTTAATGGTT CAAGTTACGT TGAATTTGGT
ATACCTATTG ACACTGAGTT AGTGTTAACT GGGCCAGTGT GTGGAATATG GGCTGTGGTT
AAAAGTGTTA ATGCAACCTT CACGTTACTT CATAGGGTTA ATGAATCATA TTACCCGGCA
CCGTACACGT GGGGTATTGG TACATTAACA GGTGAGGCTG TAGCTAATGC ATCAGCCCTA
GTGAGTAATG GTGTTAACGT TCAGATTACT GGCAGCGCCT ACGAATACCC TGGACCATTA
TACTACTATG TGCCTGTCTT CATATCATTA ATTAATGGAT CGGAATTTAT AATGGTTCCT
AAAGGATACA TGCTTAATCT AACCCTAGGT AGATTAATTA CCGGTAATTC ATCAGTAATT
AAACGCATTG AATTCGTGAT TAATGAGACG CGTATTATTA ATTCAAGTAG CGTAACTATT
ATTGTTAATG GGCCAACTGA GGTAAGGGTA ATTTATAATC AATTATTTGA AGTGAAGTTA
ATTGGGTTAA GCGGGAATGA GACGCCGTTA GTGTATTGGT ATCCTAAGGG GTATGTGCTT
AAACTTAAGG AACCAAGGTA CTTGGGTTTA ATGGTGTTTA GAGGCTACTT ACTTAACAAT
GGTACGCTAG TTAAGTATCC TGAAGCTACA TTGATAATTA ATGGTTCATT AACAATTAAG
GTACTGTGGG GTAATGAAGT GAGTATAGGT ACCTTAACGG TAATGTACCT GGTGTTTCCT
GTATTATCAT TATTAATGAT TATGATATTG ATTATGCTTA CCCTAAGTGA TGAAGGTAAT
CGTCATTAG
 
Protein sequence
MIMLALFIAA LMQPQLVNVT PVSFNMTIGS GMPMYGLLIN PNSSYVIYLN GPGVLYMVAN 
SSLVVMIHNM VHVVNGSASL VIKQGESRVL FINHNNYSVY LFYMFQYNSS SEAFYSYNPI
GVADYGVALY YGEPLLAYSY ETSEVLGVAF IRSLNVTDVR GDCGVKAGDD YADIQLNSIV
KAGDGYYIVQ DVVILNGTAA SIVDNVWNIT SLNATLSNVM GLGSIGDFNG QQYYAYSRVI
GELKTPFNLT LAIMVSGVNS AHLSFGYGVQ GSLIWFDNVT LINAGKPSII VNGSSYVEFG
IPIDTELVLT GPVCGIWAVV KSVNATFTLL HRVNESYYPA PYTWGIGTLT GEAVANASAL
VSNGVNVQIT GSAYEYPGPL YYYVPVFISL INGSEFIMVP KGYMLNLTLG RLITGNSSVI
KRIEFVINET RIINSSSVTI IVNGPTEVRV IYNQLFEVKL IGLSGNETPL VYWYPKGYVL
KLKEPRYLGL MVFRGYLLNN GTLVKYPEAT LIINGSLTIK VLWGNEVSIG TLTVMYLVFP
VLSLLMIMIL IMLTLSDEGN RH