13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1231 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1231  peptidase A5, thermopsin  100 
 
 
924 aa  1805    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2141  conserved hypothetical protein  40.73 
 
 
599 aa  299  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0411  conserved hypothetical protein  44.76 
 
 
986 aa  208  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  28.21 
 
 
944 aa  99.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2683  Thermopsin  43.27 
 
 
556 aa  95.1  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  26.95 
 
 
952 aa  92.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1230  thermopsin  33.2 
 
 
320 aa  88.6  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0086  hypothetical protein  27.1 
 
 
562 aa  61.2  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.876374  normal  0.238085 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1460  thermopsin  27.02 
 
 
586 aa  58.2  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0013  Peptidase A5, thermopsin  28.97 
 
 
442 aa  56.2  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0696  peptidase A5, thermopsin  26.85 
 
 
430 aa  49.3  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1192  hypothetical protein  26.02 
 
 
409 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.288324  hitchhiker  0.0000771077 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1285  hypothetical protein  29.94 
 
 
671 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.328698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>