11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1230 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1230  thermopsin  100 
 
 
320 aa  631  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  41.26 
 
 
952 aa  186  5e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1460  thermopsin  35.69 
 
 
586 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2683  Thermopsin  39.64 
 
 
556 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  35.62 
 
 
944 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1231  peptidase A5, thermopsin  33.2 
 
 
924 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1285  hypothetical protein  29.5 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.328698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0696  peptidase A5, thermopsin  31.68 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0086  hypothetical protein  29.32 
 
 
562 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.876374  normal  0.238085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0013  Peptidase A5, thermopsin  30.48 
 
 
442 aa  59.3  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1192  hypothetical protein  27.15 
 
 
409 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.288324  hitchhiker  0.0000771077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>