9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0086 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0086  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1113    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.876374  normal  0.238085 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  30.94 
 
 
952 aa  84  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  29.67 
 
 
944 aa  76.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1285  hypothetical protein  28.63 
 
 
671 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.328698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1230  thermopsin  29.32 
 
 
320 aa  63.9  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1460  thermopsin  27.51 
 
 
586 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1231  peptidase A5, thermopsin  27.1 
 
 
924 aa  61.6  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1192  hypothetical protein  26.93 
 
 
409 aa  60.5  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.288324  hitchhiker  0.0000771077 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2683  Thermopsin  26.67 
 
 
556 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>