59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1078 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1516    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  41.31 
 
 		 751 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.52 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  37.97 
 
 		 636 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  39.87 
 
 		 822 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  38.74 
 
 		 794 aa  214  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  25.62 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.71 
 
 		 792 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  27.8 
 
 		 637 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  30.25 
 
 		 642 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  28.57 
 
 		 968 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.97 
 
 		 886 aa  81.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  27.45 
 
 		 963 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  25.68 
 
 		 969 aa  77.4  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  28.42 
 
 		 950 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  38.54 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  39.08 
 
 		 1483 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.83 
 
 		 4896 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  23.64 
 
 		 2377 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  30.09 
 
 		 836 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  29.25 
 
 		 599 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  31.15 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  30.43 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  38.55 
 
 		 2402 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  34.12 
 
 		 3793 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  39.08 
 
 		 1152 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.83 
 
 		 3927 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1980 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1067 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  37.21 
 
 		 3227 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  35.23 
 
 		 4071 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  36.13 
 
 		 1389 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  37.36 
 
 		 2270 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  23.23 
 
 		 373 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  31.58 
 
 		 689 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.92 
 
 		 885 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  32.76 
 
 		 2833 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  32.43 
 
 		 711 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.14 
 
 		 2296 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1111 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  28 
 
 		 1526 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.44 
 
 		 2927 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  33.82 
 
 		 3471 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1259 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1059 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  29.6 
 
 		 429 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  33.85 
 
 		 581 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  26.47 
 
 		 2772 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  32.58 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  31.63 
 
 		 2411 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  31.63 
 
 		 2421 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.63 
 
 		 2367 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  31.63 
 
 		 2454 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  34.57 
 
 		 3602 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  31.63 
 
 		 2807 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  32.94 
 
 		 658 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  31.03 
 
 		 750 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  28.67 
 
 		 650 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1066 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>