63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3397 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3397  S-layer domain protein  100 
 
 
760 aa  1528    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00005416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2348  Ig-related protein  28.63 
 
 
1036 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0040576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3398  hypothetical protein  26.64 
 
 
974 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000354514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0438  S-layer domain protein  25.21 
 
 
1157 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  31.79 
 
 
1018 aa  60.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  25 
 
 
1756 aa  60.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  32.21 
 
 
506 aa  58.9  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  32.81 
 
 
1821 aa  58.9  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.65 
 
 
1016 aa  57.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 
1661 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  30.6 
 
 
733 aa  56.6  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  26.85 
 
 
4630 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  31.07 
 
 
573 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  25.51 
 
 
189 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  23.05 
 
 
807 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  33.68 
 
 
914 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  32.22 
 
 
413 aa  53.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.77 
 
 
688 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.38 
 
 
447 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  28.03 
 
 
625 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  33.33 
 
 
880 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  32.63 
 
 
939 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  26.24 
 
 
631 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  33.33 
 
 
717 aa  51.2  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  33.33 
 
 
754 aa  50.8  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.47 
 
 
756 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  34.09 
 
 
935 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29 
 
 
2313 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  27.92 
 
 
692 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  30.82 
 
 
935 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  29.91 
 
 
2375 aa  48.9  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  26.63 
 
 
1184 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 
558 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  28.66 
 
 
410 aa  48.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  25.83 
 
 
1457 aa  47.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  23.21 
 
 
819 aa  48.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.43 
 
 
506 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  29.7 
 
 
693 aa  47.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.18 
 
 
3027 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  29.57 
 
 
3320 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  34.88 
 
 
1050 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  39.22 
 
 
609 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  25 
 
 
2178 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  26.61 
 
 
414 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  36.36 
 
 
546 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  33.33 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.87 
 
 
1009 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  30.43 
 
 
1208 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30.41 
 
 
710 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  26.53 
 
 
758 aa  46.2  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  30.86 
 
 
932 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.71 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.71 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.71 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.71 
 
 
410 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3132  S-layer domain protein  32.39 
 
 
478 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000238751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  35.19 
 
 
1729 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.71 
 
 
1054 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.71 
 
 
410 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  33.75 
 
 
527 aa  44.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.63 
 
 
410 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2633  S-layer domain protein  30.99 
 
 
475 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  30.91 
 
 
834 aa  44.3  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>