120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3132 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2633  S-layer domain protein  81.43 
 
 		 475 aa  799    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3132  S-layer domain protein  100 
 
 		 478 aa  974    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000238751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  24.03 
 
 		 921 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  25.84 
 
 		 4630 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  26.39 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  29.03 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.37 
 
 		 1847 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  24.65 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  21.95 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  25.59 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  25.73 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.39 
 
 		 1234 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  24.43 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.92 
 
 		 1054 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.24 
 
 		 1661 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  22.87 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  23.08 
 
 		 710 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  22.22 
 
 		 834 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  23.72 
 
 		 1821 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  22.22 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.87 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  23.47 
 
 		 748 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.73 
 
 		 1016 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  22.89 
 
 		 518 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  24.52 
 
 		 1154 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3089  S-layer protein  26.09 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.706009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  42.65 
 
 		 521 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2344  S-layer domain-containing protein  25.11 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  23.41 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  35.71 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  32.1 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2982  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  26.6 
 
 		 591 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  24.45 
 
 		 585 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3033  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  26.6 
 
 		 591 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3311  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.6 
 
 		 591 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1194 aa  54.3  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  23.59 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  22.55 
 
 		 758 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  25.12 
 
 		 599 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.12 
 
 		 599 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  31.17 
 
 		 693 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  20.39 
 
 		 504 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.08 
 
 		 995 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  23.88 
 
 		 1208 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  34.29 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  25.23 
 
 		 1495 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.35 
 
 		 3027 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  21.69 
 
 		 218 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  34.78 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3295  S-layer protein, putative  26.11 
 
 		 591 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0039  S-layer domain protein  25.57 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  23.74 
 
 		 3320 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  34.78 
 
 		 669 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  38.18 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  33.85 
 
 		 624 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1457 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  30.99 
 
 		 387 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4146  S-layer domain protein  20.49 
 
 		 343 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  hitchhiker  0.00000163771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  24.4 
 
 		 807 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  31.19 
 
 		 932 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1756 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  38.3 
 
 		 631 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  36 
 
 		 552 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.26 
 
 		 2313 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.22 
 
 		 1328 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  21.13 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  29.89 
 
 		 717 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  30.77 
 
 		 625 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  29.72 
 
 		 1042 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.11 
 
 		 591 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.653459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  24.1 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  23.12 
 
 		 2375 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  38 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1260 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  32.08 
 
 		 820 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  27.33 
 
 		 530 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  22.22 
 
 		 575 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  34 
 
 		 1226 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  36.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  36.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  36.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  31.94 
 
 		 733 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  36.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  22.82 
 
 		 935 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  43.75 
 
 		 1036 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  25 
 
 		 1421 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  26.42 
 
 		 1223 aa  47  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  23.96 
 
 		 926 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  30.95 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  27.33 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.28 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.28 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.26 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  27.33 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.26 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>