228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2384 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0438  S-layer domain protein  36.36 
 
 		 1157 aa  90.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  32.34 
 
 		 1018 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  28.66 
 
 		 552 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  34.39 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  28.03 
 
 		 1226 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 631 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  31.29 
 
 		 412 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.58 
 
 		 1009 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 857 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.56 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  35.05 
 
 		 1081 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  31.88 
 
 		 935 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  26.21 
 
 		 758 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  37 
 
 		 921 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  25.61 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  33.12 
 
 		 1208 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.36 
 
 		 1710 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  25 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28.66 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  26.63 
 
 		 669 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.14 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.62 
 
 		 2313 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  26.22 
 
 		 693 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.89 
 
 		 1328 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  30.41 
 
 		 518 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2295  S-layer domain protein  28.25 
 
 		 1074 aa  64.3  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  26.25 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.82 
 
 		 4630 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1756 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  36.17 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  31.86 
 
 		 710 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  29.93 
 
 		 536 aa  62  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.54 
 
 		 685 aa  62  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  28.15 
 
 		 288 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 1321 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.65 
 
 		 3027 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4531  S-layer region-like  31 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  31.96 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1943  S-layer domain protein  28.91 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00316306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  30.58 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  24.39 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  30.25 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 		 1234 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  23.31 
 
 		 1821 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  32.23 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  31.25 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  33.04 
 
 		 834 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 		 1231 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.41 
 
 		 926 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  31.96 
 
 		 573 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  36 
 
 		 1194 aa  58.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  26.88 
 
 		 693 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  32.98 
 
 		 1168 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  32.32 
 
 		 625 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  26.87 
 
 		 920 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  34.26 
 
 		 548 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  25.63 
 
 		 657 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 692 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1026  S-layer protein  27.05 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00354744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  23.42 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  32.99 
 
 		 660 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.91 
 
 		 629 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  29.29 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  29.29 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  27.97 
 
 		 548 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  25.61 
 
 		 1174 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3397  S-layer domain protein  25.51 
 
 		 760 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00005416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  34.51 
 
 		 1847 aa  54.3  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  27.44 
 
 		 932 aa  54.7  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  27.72 
 
 		 524 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  32.32 
 
 		 767 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  34.31 
 
 		 615 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  25.42 
 
 		 410 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  23.87 
 
 		 396 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  28.26 
 
 		 627 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  25.4 
 
 		 472 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  24.1 
 
 		 413 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  40 
 
 		 575 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  25.81 
 
 		 733 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  28.57 
 
 		 620 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  25.71 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  25.71 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  25.71 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  24.87 
 
 		 472 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 		 572 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 		 567 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  26.06 
 
 		 530 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.68 
 
 		 567 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1573  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1055 aa  52  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  21.74 
 
 		 431 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  28.26 
 
 		 1042 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  24.87 
 
 		 410 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  38.98 
 
 		 504 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  27.45 
 
 		 620 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1260 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  27.63 
 
 		 754 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1184 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  25.48 
 
 		 807 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>