81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0838 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1418    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  33.47 
 
 		 476 aa  247  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  27.72 
 
 		 477 aa  167  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  25.98 
 
 		 474 aa  148  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  25.32 
 
 		 852 aa  87.8  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  26.3 
 
 		 745 aa  87.4  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  28.48 
 
 		 717 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 738 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  25.08 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 721 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  25.35 
 
 		 708 aa  70.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  21.39 
 
 		 749 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  26.98 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  25.4 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  24.19 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  19.51 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  25.42 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  25.42 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 783 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  27.27 
 
 		 516 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 783 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 783 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  27.75 
 
 		 783 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  27.75 
 
 		 783 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 790 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  28.92 
 
 		 510 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  27.17 
 
 		 783 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  27.17 
 
 		 783 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  26.26 
 
 		 445 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.58 
 
 		 444 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  22.45 
 
 		 543 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  27.11 
 
 		 478 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  31.45 
 
 		 509 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  24.69 
 
 		 529 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  24.62 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  24.62 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  24.62 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  24.62 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.93 
 
 		 810 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  22.16 
 
 		 914 aa  50.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  32.17 
 
 		 423 aa  50.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  24.1 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  24.1 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  24.1 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  24.1 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  24.14 
 
 		 896 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  24.1 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  21.24 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  21.24 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  23.16 
 
 		 524 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.85 
 
 		 566 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  21.24 
 
 		 549 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  21.24 
 
 		 549 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  21.24 
 
 		 549 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  26.2 
 
 		 886 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  24.75 
 
 		 915 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  23.83 
 
 		 544 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.36 
 
 		 718 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  22.92 
 
 		 549 aa  47.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  25 
 
 		 733 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  24.75 
 
 		 915 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  23.22 
 
 		 913 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  22.42 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  21.94 
 
 		 568 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  24.69 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  23.16 
 
 		 433 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  23.16 
 
 		 891 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.24 
 
 		 731 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  23.56 
 
 		 892 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  29.1 
 
 		 440 aa  44.3  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  24.54 
 
 		 919 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.7 
 
 		 785 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>