94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0119 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  100 
 
 		 529 aa  1072    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  58.82 
 
 		 495 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  59.35 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  59.35 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  46.93 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  46.11 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  45.45 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  35.77 
 
 		 751 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  33.98 
 
 		 621 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  35.79 
 
 		 811 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02790  alpha,alpha-trehalase, putative  32.57 
 
 		 875 aa  250  5e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  36.45 
 
 		 535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  38.07 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  37.14 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5070  Alpha,alpha-trehalase  35 
 
 		 537 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.379512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  34.52 
 
 		 565 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  34.52 
 
 		 565 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  34.52 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  35.87 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  34.52 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  34.52 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  34.52 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  34.52 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  36.02 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  36.41 
 
 		 561 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  33.03 
 
 		 733 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  37.26 
 
 		 568 aa  224  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  36.02 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  35.78 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  35.78 
 
 		 570 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1543  trehalase  36.19 
 
 		 607 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1752  trehalase  35.28 
 
 		 562 aa  220  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1166  trehalase  36.19 
 
 		 564 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.286501  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0075  trehalase  36.19 
 
 		 564 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  34.42 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2235  trehalase  36.19 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2671  Alpha,alpha-trehalase  35.07 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5421  Alpha,alpha-trehalase  37.05 
 
 		 572 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0889031  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0995  trehalase  36.19 
 
 		 623 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4864  Alpha,alpha-trehalase  37.05 
 
 		 572 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3502  Alpha,alpha-trehalase  37.05 
 
 		 572 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0908  trehalase  36.19 
 
 		 565 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  36.14 
 
 		 536 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5280  Alpha,alpha-trehalase  35.61 
 
 		 574 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  0.173733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  33.63 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  35.52 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  33.65 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  33.41 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0851  Alpha,alpha-trehalase  33.46 
 
 		 578 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0110483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  33.41 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  32.45 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  32.45 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  32.45 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5350  Alpha,alpha-trehalase  35.29 
 
 		 557 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  30.88 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  32.23 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  32.23 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3734  Alpha,alpha-trehalase  33.41 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  0.116686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4237  Alpha,alpha-trehalase  35.99 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.289952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  33.03 
 
 		 549 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4760  Alpha,alpha-trehalase  35.68 
 
 		 576 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  33.09 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  34.4 
 
 		 588 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0277  periplasmic alpha,alpha-trehalase signal peptide protein  34.2 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  32.45 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38852  predicted protein  32.23 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.569718 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00690  trehalase precursor, putative  23.96 
 
 		 691 aa  97.1  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.689154  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  27.32 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  32.82 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  24.14 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  29.22 
 
 		 732 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  28.89 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  24.83 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.15 
 
 		 717 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 581 aa  53.9  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  24.69 
 
 		 681 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  26.56 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  28.48 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  22.97 
 
 		 708 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  19.94 
 
 		 852 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  27.5 
 
 		 706 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  28.65 
 
 		 715 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.74 
 
 		 566 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  25.49 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>