106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0668 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  869    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  46.28 
 
 
431 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  43.99 
 
 
433 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  46.49 
 
 
422 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  45.91 
 
 
424 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  42.75 
 
 
419 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  42.72 
 
 
444 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  42.92 
 
 
452 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  37.97 
 
 
441 aa  289  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  37.27 
 
 
468 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  37.15 
 
 
456 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  37.39 
 
 
459 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  36.09 
 
 
452 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  36.64 
 
 
446 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  37.33 
 
 
446 aa  249  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  35.94 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  35.96 
 
 
478 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  36.18 
 
 
450 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  36.18 
 
 
446 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  36.18 
 
 
446 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  36.3 
 
 
439 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  33.96 
 
 
432 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  34.59 
 
 
441 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  34.04 
 
 
440 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 
581 aa  140  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  27.07 
 
 
717 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  26.37 
 
 
732 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  25.85 
 
 
708 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 
738 aa  96.3  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
721 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  24.19 
 
 
444 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
718 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  23.31 
 
 
745 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  35.47 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.19 
 
 
852 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  27.1 
 
 
896 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  22.44 
 
 
790 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  30.38 
 
 
476 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  25.7 
 
 
566 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.91 
 
 
734 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  35.25 
 
 
575 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.59 
 
 
734 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  25.37 
 
 
509 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  35.09 
 
 
723 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  30 
 
 
514 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  30 
 
 
514 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.92 
 
 
734 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.08 
 
 
736 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.26 
 
 
729 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.65 
 
 
543 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.58 
 
 
729 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  25.44 
 
 
896 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05635  Neutral trehalase (EC 3.2.1.28)(Alpha,alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O42777]  31.78 
 
 
751 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668191  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.82 
 
 
751 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  25.11 
 
 
588 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.48 
 
 
736 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  24.23 
 
 
811 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
783 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
783 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
783 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  32.17 
 
 
681 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
783 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  25.64 
 
 
783 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  29.87 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  25.64 
 
 
783 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.38 
 
 
741 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  28.33 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  23.72 
 
 
783 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.08 
 
 
781 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  27.21 
 
 
783 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  23.58 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  28.3 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  28.3 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  28.3 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  28.3 
 
 
549 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  28.3 
 
 
549 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1262  Alpha,alpha-trehalase  25.58 
 
 
621 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.41 
 
 
732 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  30 
 
 
733 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  29.93 
 
 
706 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  25.66 
 
 
549 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  30 
 
 
720 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.46 
 
 
764 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  27.64 
 
 
914 aa  46.6  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.31 
 
 
723 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.73 
 
 
724 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.46 
 
 
765 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  26.38 
 
 
510 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.57 
 
 
731 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.91 
 
 
732 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  22.19 
 
 
544 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.2 
 
 
612 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.878962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>