47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4815 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  923    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  74.6 
 
 		 450 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  75.28 
 
 		 446 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  74.6 
 
 		 446 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  74.43 
 
 		 446 aa  683    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  74.6 
 
 		 446 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  54.59 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  56.14 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  53.93 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  51.13 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  47.67 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  38.88 
 
 		 452 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  36.09 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  34.24 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  35.47 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  35.25 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  34.1 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  35.43 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  37.64 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  31.75 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  34.87 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  33.11 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  29.08 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  33.11 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  26.22 
 
 		 708 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  33.81 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  29.17 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.45 
 
 		 717 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  20.31 
 
 		 852 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.8 
 
 		 566 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  22.96 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 718 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  21.83 
 
 		 738 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.12 
 
 		 732 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  28.46 
 
 		 783 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  28.69 
 
 		 783 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  28.46 
 
 		 783 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  28.46 
 
 		 783 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  28.69 
 
 		 783 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  28.69 
 
 		 783 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  29.17 
 
 		 783 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  21.32 
 
 		 575 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  27.87 
 
 		 783 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 721 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  30 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  27.85 
 
 		 886 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>