48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1462 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  809    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  30.5 
 
 
452 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  30.43 
 
 
468 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  29.41 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  30.48 
 
 
452 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  28.43 
 
 
446 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  27.38 
 
 
431 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  29 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  27.91 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  28.16 
 
 
456 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  29.83 
 
 
446 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  28.8 
 
 
478 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  28.19 
 
 
446 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  28.19 
 
 
446 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  28.19 
 
 
450 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  28.01 
 
 
422 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  24.41 
 
 
433 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  28.75 
 
 
441 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  28.51 
 
 
441 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  27.53 
 
 
444 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
581 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  28.86 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  29.16 
 
 
432 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  24.35 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  26.5 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  25.24 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.38 
 
 
566 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  20.8 
 
 
852 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  24.66 
 
 
708 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.93 
 
 
717 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  23.93 
 
 
732 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0637  hypothetical protein  31.06 
 
 
533 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  25.95 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  25.64 
 
 
749 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.27 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  25.36 
 
 
575 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  28.06 
 
 
745 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  22.03 
 
 
721 aa  49.7  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.32 
 
 
759 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  26.67 
 
 
516 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  21.51 
 
 
833 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.05 
 
 
718 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  26.83 
 
 
510 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  28.03 
 
 
524 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
738 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  21.52 
 
 
681 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  23.86 
 
 
783 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>