46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1673 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  882    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  55.79 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  51.48 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  49.2 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  47.83 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  48.28 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  47.59 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  47.05 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  47.59 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  47.59 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  47.1 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  38.99 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  36.85 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  35.01 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  35.19 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  36.07 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  33.63 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  36.92 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  32.74 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  34.02 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  31.38 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  35.54 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  34.1 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  34.62 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 581 aa  90.9  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  35.1 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  25.18 
 
 		 708 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  26.2 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.31 
 
 		 732 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 718 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.15 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  24.55 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 721 aa  60.1  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 738 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.47 
 
 		 852 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  23.64 
 
 		 745 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  36.78 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  24.24 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 783 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 783 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 783 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 783 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 783 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  26.62 
 
 		 465 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 783 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  28.57 
 
 		 783 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>