41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6050 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  91.26 
 
 		 450 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  74.43 
 
 		 452 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  91.93 
 
 		 446 aa  848    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  91.26 
 
 		 446 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  909    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  91.26 
 
 		 446 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  53.93 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  53.93 
 
 		 439 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  54.2 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  53.62 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  48.13 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  42.57 
 
 		 452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  37.33 
 
 		 423 aa  249  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  35.15 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  36.24 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  37.9 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  36.79 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  36.09 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  34.02 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  35.12 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  35.76 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  33.26 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  31.51 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  26.87 
 
 		 708 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 		 581 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.11 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  25.75 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  21.35 
 
 		 852 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  34.4 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 738 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  21.92 
 
 		 732 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.87 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  22.2 
 
 		 721 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.94 
 
 		 718 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  23.88 
 
 		 745 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  25.24 
 
 		 914 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  26.97 
 
 		 566 aa  43.5  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  29.27 
 
 		 783 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  29.27 
 
 		 783 aa  43.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  29.27 
 
 		 783 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>