133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1774 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 		 444 aa  914    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  47.56 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  47.11 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  42.72 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  36.98 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  38.46 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  38.72 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  38.58 
 
 		 478 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  38.82 
 
 		 419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  39.01 
 
 		 468 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  37.61 
 
 		 459 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  36.02 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  34.66 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  36.78 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  34.84 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  34.91 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  35.15 
 
 		 446 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  35.1 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  34.24 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  32.95 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  32.95 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  32.95 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  34.43 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  34.92 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 		 581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  27.27 
 
 		 708 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  27.59 
 
 		 717 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 721 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  25.41 
 
 		 732 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 738 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  25.3 
 
 		 852 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 718 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  26.84 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  25.35 
 
 		 783 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  25.35 
 
 		 783 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  25.15 
 
 		 783 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  25.35 
 
 		 783 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  25.35 
 
 		 783 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  25.15 
 
 		 783 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  25.15 
 
 		 783 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  24.85 
 
 		 783 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  34.94 
 
 		 543 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  24.66 
 
 		 745 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  26.03 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  26.03 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  23.26 
 
 		 790 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0144  Alpha,alpha-trehalase  29.79 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  24.03 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  27.05 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  31.15 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  21.67 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  26.27 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  26.98 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  26.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  29.06 
 
 		 557 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  21.56 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  26.04 
 
 		 896 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  25.71 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  26.77 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  23.71 
 
 		 896 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  20.92 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  29.13 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3875  trehalase  29.45 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3917  trehalase  29.45 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3978  trehalase  29.45 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.744709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  22.17 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  29.21 
 
 		 733 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  26.64 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  29.61 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  28.91 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  23.67 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  31.76 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0217  trehalase  25.32 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  23.3 
 
 		 569 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3797  trehalase  28.83 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3810  trehalase  28.83 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  22.71 
 
 		 811 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  24.24 
 
 		 914 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  22.32 
 
 		 512 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  23.19 
 
 		 570 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  24.88 
 
 		 749 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.34 
 
 		 722 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  22.71 
 
 		 570 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  30.41 
 
 		 706 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  25.68 
 
 		 833 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>