200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1011 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 581 aa  1205    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  30.08 
 
 		 708 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  29.67 
 
 		 444 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  28.43 
 
 		 717 aa  146  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  26.04 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  27.85 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 721 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  27.72 
 
 		 423 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  27.96 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  26.78 
 
 		 445 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 718 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  27.64 
 
 		 431 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 738 aa  134  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.5 
 
 		 543 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  26.65 
 
 		 444 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  25.25 
 
 		 433 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  25.2 
 
 		 852 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  27.38 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  26.4 
 
 		 745 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  27.49 
 
 		 681 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  26.02 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  29.67 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  30.73 
 
 		 896 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  29.67 
 
 		 783 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  24.06 
 
 		 422 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  26.06 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  24.53 
 
 		 456 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  24.7 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  28.85 
 
 		 790 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  28.38 
 
 		 896 aa  97.8  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  25.79 
 
 		 432 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  24.59 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  30.08 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  23.54 
 
 		 450 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  24.35 
 
 		 446 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  22.91 
 
 		 440 aa  87  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  23.54 
 
 		 446 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  23.54 
 
 		 446 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  23.08 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01172  periplasmic trehalase  27.49 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.974983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2451  Alpha,alpha-trehalase  27.49 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.203775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  25.06 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1946  trehalase  27.09 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2429  trehalase  27.49 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.414079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01182  hypothetical protein  27.49 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1301  trehalase  27.49 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1343  trehalase  27.49 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3506  Alpha,alpha-trehalase  26.72 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  22.87 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1994  trehalase  29.11 
 
 		 569 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2355  trehalase  26.29 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2117  Alpha,alpha-trehalase  24.84 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.99 
 
 		 726 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1938  trehalase  28.97 
 
 		 570 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  32.12 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  23.97 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  24.25 
 
 		 833 aa  75.1  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1522  trehalase  28.97 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  30.28 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1337  trehalase  28.5 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  23.46 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.44 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.09 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  24.68 
 
 		 914 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1934  trehalase  28.5 
 
 		 570 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.61 
 
 		 731 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  23.51 
 
 		 749 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5014  Alpha,alpha-trehalase  28.4 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04165  trehalase  22.03 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2843  trehalase  29.44 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  28.74 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  23.69 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.8 
 
 		 732 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.69 
 
 		 720 aa  67  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7106  Alpha,alpha-trehalase  27.7 
 
 		 536 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33450  trehalase  28.97 
 
 		 545 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.804873  normal  0.137988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.94 
 
 		 698 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.15 
 
 		 765 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.81 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1435  trehalase  26.47 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0656855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.13 
 
 		 734 aa  64.7  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.67 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6048  Alpha,alpha-trehalase  29.34 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.47 
 
 		 781 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.07 
 
 		 778 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  24.58 
 
 		 712 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.54 
 
 		 778 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.54 
 
 		 778 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.89 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  24.85 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  20.57 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3914  trehalase  26.11 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  21.89 
 
 		 733 aa  60.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>