89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3745 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  56.41 
 
 		 717 aa  785    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 738 aa  1508    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  61.05 
 
 		 718 aa  918    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  60.44 
 
 		 721 aa  915    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  40.78 
 
 		 852 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  43.56 
 
 		 732 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  41.2 
 
 		 708 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  35.95 
 
 		 790 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  35.63 
 
 		 783 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  35.76 
 
 		 783 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  35.76 
 
 		 783 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  35.63 
 
 		 783 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  35.63 
 
 		 783 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  35.55 
 
 		 783 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  35.51 
 
 		 783 aa  439  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  34.67 
 
 		 783 aa  439  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  31.75 
 
 		 896 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  30.91 
 
 		 896 aa  194  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 581 aa  134  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  27.7 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  26.04 
 
 		 441 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  27.31 
 
 		 543 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  28.08 
 
 		 444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  23.49 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  26.3 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  26.23 
 
 		 423 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  28.43 
 
 		 745 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  24.24 
 
 		 445 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  22.14 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  21.6 
 
 		 433 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  28.79 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  26.45 
 
 		 681 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  22.07 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  26.04 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  23.75 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  23.24 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  25.45 
 
 		 440 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  24.1 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  24.1 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  21.86 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  25.06 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  21.66 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  25.74 
 
 		 468 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  29.89 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  27.13 
 
 		 544 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  25.23 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  24.26 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  22.29 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  23.73 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  23.86 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  25.47 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  23.02 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.68 
 
 		 734 aa  57.4  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.64 
 
 		 716 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64968  Neutral trehalase (Alpha,alpha-trehalase) (Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase)  26.92 
 
 		 811 aa  56.2  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.332926  normal  0.0654828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  25 
 
 		 757 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  21.7 
 
 		 477 aa  55.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.25 
 
 		 741 aa  54.3  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.75 
 
 		 444 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  23.72 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  23.72 
 
 		 450 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  23.72 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.14 
 
 		 724 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.79 
 
 		 781 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  24.04 
 
 		 757 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  19.37 
 
 		 914 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.64 
 
 		 723 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  22.27 
 
 		 452 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.41 
 
 		 700 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  21.3 
 
 		 737 aa  49.3  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.8 
 
 		 732 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  25.09 
 
 		 441 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.07 
 
 		 628 aa  48.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  20.49 
 
 		 725 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.41 
 
 		 736 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  24.06 
 
 		 901 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  25.13 
 
 		 712 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  30.86 
 
 		 723 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39865  Mannosyl-oligosaccharide glucosidase (Processing A-glucosidase I) (Glucosidase I)  19.27 
 
 		 833 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.589522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.06 
 
 		 764 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.13 
 
 		 719 aa  45.8  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.01 
 
 		 711 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.4 
 
 		 731 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.55 
 
 		 734 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  24.76 
 
 		 706 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  34.94 
 
 		 424 aa  44.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.79 
 
 		 765 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  26.67 
 
 		 912 aa  44.3  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>