65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0333 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  903    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  59.09 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  46.28 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  40.19 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  36.98 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  40.86 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  36.87 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  37.76 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  33.95 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  33.03 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  32.27 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  32.1 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  32.43 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  31.01 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  29.3 
 
 		 456 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  31.64 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  31.54 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  31.54 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  31.54 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  31.63 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  31.51 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  29.08 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  30.12 
 
 		 441 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  29.64 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  23.04 
 
 		 717 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.11 
 
 		 732 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  22.27 
 
 		 852 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  22.78 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  22.14 
 
 		 738 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  24.27 
 
 		 708 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  21.93 
 
 		 718 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  30.38 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.25 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  26.63 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  22.8 
 
 		 896 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.47 
 
 		 732 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  23.13 
 
 		 783 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  23.13 
 
 		 783 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  19.54 
 
 		 566 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  22.9 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.74 
 
 		 729 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  22.9 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  22.9 
 
 		 783 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  22.68 
 
 		 783 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  22.68 
 
 		 783 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  22.68 
 
 		 783 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.08 
 
 		 732 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.95 
 
 		 734 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.17 
 
 		 735 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25 
 
 		 733 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.47 
 
 		 734 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.19 
 
 		 733 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  25.41 
 
 		 733 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.76 
 
 		 736 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.17 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.17 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.82 
 
 		 740 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  33.78 
 
 		 896 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.03 
 
 		 736 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.14 
 
 		 729 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  28.26 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.2 
 
 		 734 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.52 
 
 		 765 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>