116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4434 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  55.79 
 
 		 717 aa  785    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  61.67 
 
 		 738 aa  903    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 718 aa  1486    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  65.69 
 
 		 721 aa  1004    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  40.81 
 
 		 852 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  40.69 
 
 		 732 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  40.17 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  33.84 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  33.84 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  33.84 
 
 		 783 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  33.84 
 
 		 783 aa  439  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  33.59 
 
 		 783 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  33.71 
 
 		 783 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  34.88 
 
 		 790 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  33.59 
 
 		 783 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  33.84 
 
 		 783 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  30.95 
 
 		 896 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  30.06 
 
 		 896 aa  208  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 581 aa  137  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  27.4 
 
 		 441 aa  120  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  27.32 
 
 		 745 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  28.98 
 
 		 543 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  26.05 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  24.77 
 
 		 452 aa  106  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  24.94 
 
 		 478 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  22.35 
 
 		 566 aa  92.8  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  27.05 
 
 		 575 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  24.83 
 
 		 445 aa  89  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  24 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  27.41 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  28.95 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  25.33 
 
 		 459 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  20.75 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  24.42 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0333  hypothetical protein  21.93 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000122332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  24.52 
 
 		 432 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  24.11 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.34 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  25.43 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  25.43 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  24.66 
 
 		 422 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  28.24 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.53 
 
 		 727 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.24 
 
 		 781 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  27.67 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  24.78 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1825  Alpha,alpha-trehalase  22.99 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  23.24 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0169  hypothetical protein  24.32 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  21.73 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  21.25 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  25.24 
 
 		 913 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  24.46 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2832  Alpha,alpha-trehalase  26.27 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.613992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.87 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  22.88 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1356  hypothetical protein  22.07 
 
 		 424 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.848074  normal  0.800578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  24.45 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.22 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.16 
 
 		 716 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  23.05 
 
 		 914 aa  54.3  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.71 
 
 		 734 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  21.48 
 
 		 914 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.01 
 
 		 723 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.03 
 
 		 734 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  21.71 
 
 		 913 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  23.43 
 
 		 896 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4815  hypothetical protein  23.1 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  24.3 
 
 		 915 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  24.3 
 
 		 915 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.86 
 
 		 700 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.81 
 
 		 757 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  24.04 
 
 		 912 aa  50.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  21.91 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  27.48 
 
 		 896 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.2 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  23.18 
 
 		 903 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.63 
 
 		 759 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.12 
 
 		 722 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  24.11 
 
 		 529 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  22.08 
 
 		 712 aa  48.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  22.71 
 
 		 757 aa  48.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  22.3 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  22.3 
 
 		 446 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  22.3 
 
 		 446 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  22.05 
 
 		 446 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  23.67 
 
 		 901 aa  48.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  21.51 
 
 		 917 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 495 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.33 
 
 		 760 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.64 
 
 		 708 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.68 
 
 		 685 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.71 
 
 		 724 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.52 
 
 		 736 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  21.21 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.31 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  22.49 
 
 		 933 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  21.88 
 
 		 723 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.64 
 
 		 740 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  22.49 
 
 		 911 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>