121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1779 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  54.52 
 
 		 675 aa  706    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  54.61 
 
 		 770 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.67 
 
 		 740 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  53.81 
 
 		 758 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51.98 
 
 		 711 aa  694    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  53.03 
 
 		 757 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.81 
 
 		 740 aa  732    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.02 
 
 		 741 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  53.81 
 
 		 740 aa  732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.61 
 
 		 776 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.61 
 
 		 770 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.61 
 
 		 797 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  54.61 
 
 		 776 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.96 
 
 		 740 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 720 aa  1471    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.96 
 
 		 740 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.49 
 
 		 740 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  52.61 
 
 		 759 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.88 
 
 		 757 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  57.91 
 
 		 717 aa  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  58.04 
 
 		 716 aa  777    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.85 
 
 		 723 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.56 
 
 		 732 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.83 
 
 		 736 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.11 
 
 		 734 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.09 
 
 		 732 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.12 
 
 		 731 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  44.49 
 
 		 733 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.74 
 
 		 734 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.06 
 
 		 732 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.59 
 
 		 729 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.8 
 
 		 734 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.17 
 
 		 741 aa  545  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.9 
 
 		 729 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.43 
 
 		 778 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.43 
 
 		 778 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.9 
 
 		 736 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.54 
 
 		 735 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.43 
 
 		 778 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.04 
 
 		 733 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.64 
 
 		 733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.94 
 
 		 781 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.55 
 
 		 765 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.93 
 
 		 764 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.61 
 
 		 698 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.59 
 
 		 735 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.98 
 
 		 720 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.88 
 
 		 741 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.84 
 
 		 725 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  36.26 
 
 		 758 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.88 
 
 		 721 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.82 
 
 		 741 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.12 
 
 		 723 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.64 
 
 		 708 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.59 
 
 		 760 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  39.29 
 
 		 751 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.22 
 
 		 751 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.29 
 
 		 751 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.29 
 
 		 751 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.52 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  32.56 
 
 		 727 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.97 
 
 		 746 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.69 
 
 		 612 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.36 
 
 		 623 aa  365  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.48 
 
 		 733 aa  340  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.05 
 
 		 719 aa  337  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.14 
 
 		 685 aa  333  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.64 
 
 		 700 aa  330  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  33.62 
 
 		 715 aa  327  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  33.14 
 
 		 723 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  34.5 
 
 		 712 aa  324  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  33.24 
 
 		 737 aa  323  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  35.67 
 
 		 706 aa  320  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.38 
 
 		 685 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.4 
 
 		 722 aa  317  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.38 
 
 		 734 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  31.24 
 
 		 729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.84 
 
 		 628 aa  304  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.02 
 
 		 691 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.55 
 
 		 658 aa  299  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.8 
 
 		 726 aa  299  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.7 
 
 		 718 aa  296  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  33.73 
 
 		 691 aa  287  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  35.02 
 
 		 716 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.28 
 
 		 682 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  33.94 
 
 		 645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.5 
 
 		 708 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.03 
 
 		 776 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.97 
 
 		 654 aa  227  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.29 
 
 		 689 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.51 
 
 		 868 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  24.49 
 
 		 834 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.44 
 
 		 676 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.56 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  23.34 
 
 		 718 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  25.2 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  25.41 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.62 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  22.78 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>