122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0254 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  100 
 
 		 610 aa  1249    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  44.96 
 
 		 660 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  44.34 
 
 		 659 aa  492  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  43.04 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  42.15 
 
 		 659 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  43.43 
 
 		 655 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.33 
 
 		 663 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  43.17 
 
 		 668 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  38.91 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  38.02 
 
 		 674 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  37.5 
 
 		 663 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  36.38 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  37.04 
 
 		 672 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  36.55 
 
 		 712 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  39.03 
 
 		 652 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  38.31 
 
 		 681 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  36.87 
 
 		 672 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  38.41 
 
 		 662 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  38.47 
 
 		 657 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  37.77 
 
 		 657 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  38.32 
 
 		 657 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  36.59 
 
 		 686 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.91 
 
 		 720 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  34.93 
 
 		 687 aa  350  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  35.67 
 
 		 678 aa  346  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  35.52 
 
 		 678 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  38.38 
 
 		 692 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  37.06 
 
 		 672 aa  342  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  38.57 
 
 		 693 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  38.41 
 
 		 693 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.41 
 
 		 565 aa  340  7e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  34.8 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  35.78 
 
 		 651 aa  330  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.5 
 
 		 641 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  35.71 
 
 		 675 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.47 
 
 		 662 aa  316  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  32.17 
 
 		 614 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  34.27 
 
 		 660 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.9 
 
 		 659 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.46 
 
 		 656 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  30.77 
 
 		 651 aa  270  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  31.78 
 
 		 658 aa  260  5.0000000000000005e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.96 
 
 		 1433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  22.86 
 
 		 1593 aa  76.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.94 
 
 		 868 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.43 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  28.9 
 
 		 1537 aa  67  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.41 
 
 		 720 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  43.06 
 
 		 1526 aa  64.7  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.62 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  27.44 
 
 		 675 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  24.77 
 
 		 834 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.44 
 
 		 776 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.44 
 
 		 776 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  27.44 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.21 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.44 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.44 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  26.56 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.78 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.83 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.09 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.18 
 
 		 760 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  27.44 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.63 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.38 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.11 
 
 		 716 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.97 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.09 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.08 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.08 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.87 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.73 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.18 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.83 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.08 
 
 		 740 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.51 
 
 		 721 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.82 
 
 		 718 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.43 
 
 		 682 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  25.77 
 
 		 737 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.19 
 
 		 708 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.74 
 
 		 734 aa  54.7  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  26.21 
 
 		 757 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.53 
 
 		 685 aa  54.3  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.49 
 
 		 740 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.65 
 
 		 759 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  23.48 
 
 		 758 aa  53.9  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.54 
 
 		 658 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.3 
 
 		 741 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.76 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.68 
 
 		 746 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  23.8 
 
 		 698 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.56 
 
 		 723 aa  50.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.36 
 
 		 735 aa  51.2  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.4 
 
 		 757 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.65 
 
 		 654 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.48 
 
 		 724 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.56 
 
 		 751 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.22 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.84 
 
 		 722 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>